东晋沦亡
刘裕掌控朝廷，荆州刺史刘毅妒忌，企图举兵。412年刘裕争先征伐之，刘毅兵败他杀。谯蜀为东晋叛将谯纵所建。在405年时，益州刺史毛璩率军征伐江陵桓振，蜀军不肯远征，便推谯纵为主叛晋。随后攻下成都，杀死毛璩，谯纵也自号成都王。408年晋廷派刘敬宜率军征伐但失利。413年刘裕派西陵太守朱龄石率军西伐，攻占成都。谯纵溃退他杀，谯蜀亡。
卢循为孙恩继承人，桓玄为抚慰之任为永嘉太守，但他仍不时袭扰内地。404年卢循由海路攻占广州，隔年晋廷为抚慰而命他为广州刺史。410年卢循趁刘裕北伐南燕之机，与其姐夫徐道覆分二路北伐，合溃刘毅于桑洛州(今江西九江市)，乘势攻入京师建康，史称卢偱之乱。
此时刘裕已赶回，卢循和徐道覆发作内耗，卢循久攻京师不破，撤守寻阳。10月徐道覆防御江陵，为守将刘道规所败。12月卢循败于晋军，退守广州。411年刘裕派兵击杀徐道覆。卢循最初于交州被交州刺史杜慧度覆灭，投水他杀，至此乱事安定。
刘裕覆灭多少异己后，为了理直气壮称帝，前后发起两次北伐。事先南燕慕容超频频入侵，409年刘裕率军伐南燕。于次年攻破南燕国都广固，擒杀慕容超，南燕亡。然后因卢循兵变，刘裕回师。后秦由于屡遭夏主赫连勃勃入侵，国势大衰，幼主姚泓初立。416年12月刘裕再度北伐，连克许昌、洛阳。隔年刘裕兵分两路围攻关中，最初攻破长安，后秦亡。
但于该年冬季，留守京师的刘穆之忽然逝世，为免朝廷生变，刘裕不得不亲返。他命其季子刘义真同王镇恶、沈田子等诸将防卫长安，厥后诸将内哄，夏主赫连勃勃率军进犯。417年冬刘裕命刘义真等将领率军东归，遭夏军追击，元气大伤，至此北伐完毕。
关中沦陷后，刘裕开端主动谋取帝位。同年刘裕杀晋安帝，立其弟德文，为晋恭帝。420年刘裕废晋恭帝自主，开国宋，史称南朝宋，是为宋武帝，东晋至此沦亡。439年北魏一致华北后，至此进入南北朝期间。
