隋朝对边疆的少数民族采取积极的政策，既有军事对抗，也有和平交往。民族关系的主流是友好往来和经济文化交流。当时主要的少数民族有突厥、吐谷浑以及流求人等。
突厥突厥原居今西伯利亚叶尼塞河上游，以狩猎、游牧为生。五世纪中叶，被柔然征服，迁于金山（今阿尔泰山）南麓为柔然做铁工。六世纪中叶，突厥逐渐强大，打败柔然，其首领土门（姓阿史那氏）自称伊利可汗，建立突厥汗国。其子木杆可汗时，全部占据柔然的疆土，又西破哒，东败契丹，北并契骨，其疆域东至辽河上游，西至里海（一说咸海），南至大漠，北至贝加尔湖。这时突厥已有文字、官制、刑法和税法等。
隋初，突厥强大，有战士四十万，不断入侵内地。隋朝被迫修长城，驻重兵，加强防守。开皇三年（583年），隋军大败突厥。不久，突厥分裂为东、西两部，东、西突厥互相对立，两部内部各派也互相攻战。开皇十九年（599年），东突厥突利可汗战败降隋。隋封他为启民可汗，并以宗女义成公主嫁之。大业七年（611年），西突厥处罗可汗亦降隋。突厥与隋的政治、经济关系日益密切。
吐谷浑吐谷浑（tūyùhún秃浴魂），原是鲜卑族慕容部一支的首领的名字。该部原居今辽宁一带，西晋末，吐谷浑率部西迁至今甘肃，青海之间。后来以吐谷浑为姓氏，建立国家，都伏俟城（青海湖西十五里）。其官制、衣服、器用都仿效中原王朝，并使用汉文。隋初经常入侵。开皇十六年（596年），隋文帝以光化公主嫁于吐谷浑可汗。大业四年（608年），隋炀帝派军大败吐谷浑。在其地设河源（今青海兴海东南）、西海（今青海湖西）、鄯善（今新疆若羌），且末（今且末西南）四郡。
流求隋代之流求是指今台湾。当时岛上的居民是今高山族的先民，其文化与中国大陆东南沿海的文化有密切关系。隋炀帝曾于大业三年（607年），派朱宽、何蛮前往流求。次年，复命朱宽前往。大业六年，又派陈、张镇州率兵万人前往。“流求人初见船舰，以为商旅，往往诣军中贸易”。可见台湾与大陆之间在此之前已有贸易往来。
