首先在这里表明，忽必烈不是不阻止，而是心有余而力不足。
首先忽必烈的号召力不够，他不像大哥就是所谓他的上一任大汗蒙哥有威望，蒙哥是蒙古第四任大汗，在当时只有他才能驾驭整个蒙古帝国，原因是他受钦察汗国拔都鼎力支持。拔都在中亚开了个库里台大会，旨在选择拖雷系蒙哥，然而察合台和窝阔台系不服，蒙哥登上汗位后，窝阔台系蠢蠢欲动，执掌汗廷权力的海迷失不服，偷运兵器，准备造反，被蒙哥汗提前发觉，于是蒙哥先发制人，将海迷失以及窝阔台子孙投往河中处死。一直威胁拖雷家的窝阔台系瞬间一落千丈，在西凉的阔端也同样被取代，合丹、海都等王爷也受影响，至于察合台汗国呢？知道蒙哥汗厉害后，不敢硬碰硬，只有乖乖的委身于阿里麻里地区，他的西面河中地区被蒙哥汗划分给拔都，钦察汗国顿时风生云起，蒙哥是他们推举的自然钦察汗国百般服从，所以蒙哥是当时唯一被公认的大汗，他那时还派旭烈兀西征，波斯和阿拉伯地区已成了阿姆河行省领地。
蒙哥在位时之所以能不让
蒙古帝国分裂，除了他铁腕手段以外还有个原因，就是他本身以蒙古为主，不重蹈他国之法，蒙哥身居哈拉和林，牢牢控制着帝国大权，哈拉和林是蒙古的核心地带，蒙古宗王不忘祖宗之地。
然而到了忽必烈手上，情况就变了，蒙古帝国之所以分裂，也正是他不合法窃取汗位造成的，尤其是西方，术赤、察合台、窝阔台等汗国，他们都是支持阿里不哥的，原因是蒙古有幼子守灶的理念，而阿里不哥正是拖雷的幼子，蒙古传统观念的捍卫者。相对于忽必烈却不同，忽必烈虽然有实力，可他却背离蒙古传统，就像阿里不哥所说，忽必烈执意推行汉法制汉，处处为蒙古掣肘，反对汉法制汉，唯崇祖制观念不会改变。忽必烈这一点也为当时西方诸王包括本土守旧派找到口实。
忽必烈没有在蒙古所谓的斡难河源头，哈拉和林一带，反而选择在漠南开平称汗，他害怕阿里不哥设下陷阱，没有去吊唁蒙哥，直接从宋战场返回称汗，这让当时深处哈拉和林的大臣和宗王们很是恼火，忽必烈这一套做法明显就是自立门户。他提前称汗后还将年号改为中统，意思是中原正统之意，身处漠北的阿里不哥自然不服，他同样也在漠北称汗，顿时蒙古帝国内出现两个皇帝。忽必烈在漠南汉地经营多年拥有庞大的地盘，有文臣武将，像郝经、刘秉忠、张文谦、董文用等，而阿里不哥呢，则身居漠北，很少出去，他恰恰是西方蒙古诸王们最好的一颗棋子。
忽必烈虽然得到东部蒙古诸王支持还有旭烈兀的伊尔汗国支持，可在当时钦察汗国、察合台汗国、窝阔台汗国毕竟占一大席位，蒙古发言权分量很重，光靠实力是不行的，最主要还是有威望。可忽必烈恰恰缺失这一点，他打败阿里不哥后，将国都定在原金国的中都（后还用《易经》大哉乾元之意取大元为国号，放弃大蒙古国国号），而这些直接导致西方三大汗国不满，与他们不符的国号自然不服从，蒙古帝国就等于架为空虚，瞬间他们纷纷独立。加之忽必烈由于当初举措不当，为了征求称汗把握，任意将土地划分给各汗国，旭烈兀就是在那时建立伊尔汗国的，察合台也得到了一笔，可他后来改主意了。
忽必烈为了名正言顺，他既想当中原皇帝，又想当全蒙古的大汗，想让他们来年来中原支持自己，再次召开库里台大会，拥有波斯的旭烈兀肯定答应了，毕竟是自己一向崇敬的哥哥，迫于压力，拥有俄罗斯的别儿哥也答应了，中亚的阿鲁忽同样也一样。可是到了次年，旭烈兀和别儿哥相继去世，这让一向统一蒙古的国际大会没有开成，忽必烈在当时也没有办法，尽可能把他们争取到手上，于是元朝和察合台、窝阔台出现摩擦，边境时常告急。海都的出现彻底打破了元朝至尊的梦魇，窝阔台系海都根本就不承认忽必烈的合法性，在西部不断挑事。海都还一度占领了哈拉和林，忽必烈在当时根本就没有办法控制蒙古帝国的分裂，各汗国已经自治多年，大汗只是个虚名，就像东周列国中周天子一样。当时蒙古帝国地盘太大，忽必烈算只拥有中原一隅，就是金、西夏、宋、大理、吐蕃以及蒙古本土。这样的地盘对于他已经算吃得消了，至于名义上承认的伊尔汗国，只需册封一下就可以了，伊尔汗国被察合台与窝阔台汗国隔绝，元朝根本就没有驾驭伊尔汗国的可能。这场纷争后来在忽必烈孙子铁穆儿才结束，海都一死，战争结束了，蒙古帝国的西方各汗国仍名义上承认元朝是大汗汗国，但仍是高度自治的。
所以说，不是忽必烈不阻止蒙古帝国分裂，而是他已没有这种能力和威望。
从内心深处来说，忽必烈是坚决反对蒙古分裂的，因为他想当大汗。如果蒙古宗王们都分裂出去了，那他这个大汗当着又有什么意思呢？但是，客观上，他却成为促成蒙古分裂的罪魁祸首。为什么这么说呢？
第一，忽必烈是制造分裂的那个人。
当蒙哥大汗战死在南宋钓鱼城的时候，在蒙古本土监国的阿里不哥，便数次来信召忽必烈回本土，开忽里台大会选新的大汗。但是忽必烈不敢回去，因为他担心两个问题：其一，一旦回去，就离开了他自己的大本营，离开了他自己的军队，这样就很有可能被阿里不哥囚禁。其二，如果真是召开忽里台大会选新的大汗，忽必烈肯定不能获胜。因为按照幼子守灶的传统，大家会选阿里不哥；按照战功，大家又会选打下西亚一大片，战功更高的旭烈兀。所以忽必烈是绝对不会回去的。
忽必烈不但不回去，而且他还来到他的王都开平，自立为蒙古大汗。很显然，忽必烈这样做，是对蒙古选举制度的严重破坏，从根本上造成了蒙古的分裂。
当忽必烈不回蒙古本土，自立为大汗以后，阿里不哥在蒙古本土，召集所有的蒙古贵族，开了一次忽里台大会。虽然并不是所有的宗王贵族都来了，但还是有代表性的。然而忽必烈不予承认，并举兵和阿里不哥大战。显然，和大多数蒙古宗王贵族选出来的大汗争夺，这又是一种分裂行为。
第二，忽必烈是鼓动分裂的那个人。
忽必烈为了取得胜利，派人和旭烈兀联系，希望旭烈兀能够支持他。而开给旭烈兀的条件，就是允许旭烈兀成立自由王国。
本来，旭烈兀是打算回去开忽里台会议，竞选大汗的。当忽必烈给他开出这个条件以后，他忽然发现，其实根本就不用回去了。因为就算回去竞争，未必能争得过阿里不哥。现在白得一个自由王国，何乐而不为。
可以说，在忽必烈鼓动下的旭烈兀的分裂，是蒙古第一次，也是最大的一次分裂。
旭烈兀分裂以后，金帐汗国、察合台汗国，包括东道诸王们，也纷纷开始分裂。而大家的分裂，忽必烈基本上是无可奈何的。并不是他打不赢他们，是因为他找不到理由打他们。既然你忽必烈同意旭烈兀分裂，为什么就不同意我们分裂呢？
第三，忽必烈是扩大分裂的那个人。
忽必烈在和阿里不哥争夺汗位的时候，原本被蒙哥严厉打压过的窝阔台家族的后人，强势崛起。
海都的崛起，针对的就是忽必烈。而因为要对付强势的海都，忽必烈不得不拉拢金帐汗国和察合台汗国的后人。而拉拢的办法，和他拉拢旭烈兀是一样的，就是允许他们高度自治。实际上就是同意他们分裂出去。就这样，忽必烈除了承认伊尔汗国独立出去以外，又相继承认金帐汗国和察合台汗国独立出去。最后不得不也承认窝阔台汗国独立出去。
这样一来，整个蒙古帝国就分裂成元朝和四大汗国了。
（参考资料：《元史》）
